Losowanie wyłoniło trzy pary ćwierćfinałowe, które rozegrają pojedyncze mecze w hali zespołu wymienionego na pierwszym miejscu w dniu 15 lutego 2012 (środa):
Trefl Sopot - Energa Czarni Słupsk
PGE Turów Zgorzelec - Asseco Prokom Gdynia
Anwil Włocławek - zespół z miejsc 5/6 po Etapie I
Ostatni z uczestników ćwierćfinałów nie jest jeszcze znany, będzie to zespół z 5. miejsca po Etapie I Tauron Basket Ligi lub zespół z 6. miejsca, jeśli Zastal Zielona Góra zajmie piątą lub wyższą lokatę po Etapie I.
Turniej finałowy Intermarché Basket Cup - Pucharu Polski 2012 odbędzie się w dniach 18 i 19 lutego 2012 w Zielonej Górze.
W sobotnich półfinałach zagrają:
godz. 16.30 zwycięzca Trefl/Energa Czarni - zwycięzca PGE Turów/Asseco Prokom
godz. 19.00 Zastal Zielona Góra - zwycięzca Anwil/zespół z miejsc 5 lub 6
Mecze półfinałowe pokaże TV PLK na stronie PLK.pl.
W niedzielnym finale o godzinie 16.30 zagrają zwycięzcy półfinałów. Mecz pokaże TVP Sport.