Nowakowski grał w PLK od sezonu 2008/2009 w Polonii Warszawa, a jego trenerem był pracujący obecnie w Polpharmie Wojciech Kamiński. W ostatnim sezonie zagrał w 25 spotkaniach, w których zdobywał średnio 7,6 punktów i 2,8 asysty na mecz. Obecne rozgrywki rozpoczął w barwach Anwilu Włocławek, ale ostatecznie postanowił poszukać klubu, w którym będzie odgrywał większą rolę. W Polpharmie będzie stanowił parę rozgrywających z równie młodym Tomaszem Śniegiem.
- Mieliśmy teraz tak naprawdę tylko jednego rozgrywającego. Tony Weeden może grać na tej pozycji, ale jest bardziej rzucającym. Jeśli gra jako jedynka, to zabiera się mu jego najlepsze umiejętności - rzut za trzy i penetracje - mówi Roman Olszewski, prezes SKS SSA.
W klubie nie zastanawiali się długo nad zatrudnieniem Nowakowskiego. - Skorzystaliśmy z tego, że Anwil z niego zrezygnował. Świetnie zna go trener Wojciech Kamiński, który pracował z nim w Polonii Warszawa. Dlatego postanowiliśmy podpisać z nim kontrakt aż do końca sezonu 2012/2013 - tłumaczy Olszewski.